こんんちは。
あまり詳しくないですが、物理学側の立場から書かせていただきます。

「経済物理学」とは、物理（統計物理学、量子力学 etc.）の手法を使って経済のデータを処理しよう、という学問分野です。
なので、物理学的考え方が必要不可欠です。純理論系です。
これを養うためには、理学部の方が良いと思います。

経済学部ですと、このようなアプローチはしないかな、という印象です。
大学に因るかもしれませんが。。。

私の友達（男ですが…）がこの分野の研究をしていて、株価の推移を予想しようと頑張っています！（勿論、物理の考え方を用いて）
彼曰はく、この分野は発展途上だそうです。学問自体が新しいため、解析方法とかが確立していません。
なので、とてもやりがいがある分野だと思います！