wui　さん

私が採用担当だったら、大学だけを見ないと思います。
その人がどういう人を見極めるので、薬物事件の日大ですねという発想にはならないのではないでしょうか。
ましてや5年後になると・・・。時代の流れはスピードも速いですし、忘れ去れている可能性もあります。

むしろ、wuiさん自身が日本大学の学生に本当になりたいかというところの方が大事では？　大学の在り方に納得できるかかな。なんやかんや言って、○○大学の卒業生であるというアイデンティティ（母校）という概念は大人になってもつきまとうものです。
一方で、大学のトップがどうであれ、よい友人に恵まれて、よい学びの環境があれば関係ないとも言えますが…。

受験、頑張ってくださいね。