イオさん、こんにちは！
理系女子大生コミュニティ凛のしゃもと言います。
大学では、理学部生物学科で学んでいます。

ご自身のやりたいことがはっきりとしていて、メリット・デメリットも分析されているんですね。詳しく書いてあるので回答がしやすいです！
大学生活全般としては農学部のほうがメリットが大きいけれど、研究内容としては生命科学科のほうがマッチしている、、という感じですかね。質問文を見て、私は、農学部のほうがいいのではないかなと思いました。
理由は、
①大学生活は学問だけではないので、ボランティア活動などの自分のやりたいことに挑戦する・打ち込むことも大事
②実験や実習、研究に多く時間がとられることもあるので通学時間は短いほうが負担が少ない（長時間かけて実家から通っていたけど大学院から大学の近くに越してくる人もよくいます）
③今、高校生の知識・経験から見えているよりも、面白い！と思う研究は沢山ある。研究したいことは変わるかもしれない。（少なくとも、私は入学当時の自分では予想できない研究分野で予想外の生物を扱っています笑）
です。
相談内容を見て以上のような感想を持ちましたが、やりたい研究があって、それ以外のことよりも大事にしたいなら、迷わず理工学部に行くのが良いとも思います。
あと一つ疑問なのですが、農学部でも（扱う生物は植物になるかもしれないけれど）遺伝子工学は学べる・研究できることが多いと思うのですが、それだと将来進みたい分野と異なる、ということなのでしょうか？？

色々と書きましたが、多くの人から意見をもらって、最後は自分の決断で決めるのが良いと思います！納得のいく進路選択ができるように応援しています。