なな茶さん、初めまして。こんにちは！
東京都内の大学院で建築を専攻している大学院生です。

既にご覧になっているかもしれませんが、長岡工業高等専門学校　物質工学科の進学・就職状況について少し調べてみました。
長岡高専物質工学科　進路：http://material.nagaoka-ct.ac.jp/carrier
進学先・就職先はここから分かりますが、就職先でどのような職についたかまではわかりませんね……。
研究系だったり工場での技術系だったりが多いのではないかな……と想像しますが、
これは私の想像でしかないので、オープンキャンパスの際に質問をしてみたり、お問い合わせのメールアドレスが掲載されていたので、メールで質問してみるといいのではないかな、と思います。

ちなみに、「中学生の方へ」のページ（http://material.nagaoka-ct.ac.jp/chugakusei）に、卒業生の声として【旭化成株式会社 研究・開発本部 化学・プロセス研究所 プロセス開発部】の方のコメントが掲載されていました。
一人なのでなんとも言えませんが、研究職について働いている方もいるということがわかりますね！

私の所属していた学科にも、高専から三年次編入で編入してきた同期が数人いましたが、授業についていけない！ということはなさそうでした。
編入試験を乗り越えなければ編入できないわけですので、授業についていけないようであれば編入試験の時点で落とされていると思います……。
ただ、編入後、同じ学科の他の人よりもたくさんの授業を取らなければならない可能性はありますので、若干忙しくて大変かもしれません。

少しでも参考になればと思います。
頑張ってください。応援しています！