あーずさん、こんにちは！　初めまして。
化粧品や日用品の開発にはいろいろな分野が絡んできそうなので（応用生物以外にも工学分野とかデザイン分野とか……？）、東京農工大もあーずさんの夢にあっているのではないかと思います！
どの大学からでも化粧品や日用品開発の分野には進めそうな気がしますが、あーずさんが農工大に魅力を感じているのであれば、そこを志望するのが一番いいのではないでしょうか！

あーずさんのおっしゃる通り、どう調べても化粧品関係はどこからでも行けるから、大学では学びたいことを学ぼう！と書いてありますよね。
そんなこと言われたって、学びたいことなんてわかんないし……という高校生は結構多いと思います。
それこそ、あーずさんのように進学しようとしている学科は決まっているけどその中で興味が絞れていない人、そもそも学科もしかしたら学部、そもそも文理すらどうしようかと悩んでいる人もいるかもしれません。
学科を選ぶとなるといろいろ慎重になりがちですが、あーずさんはもう進もうと思っている学科が決まっているので、その中で何を中心に学びたいか？ということが決まらなくても、そんなに身構えなくてもいいのではないでしょうか。
だいたいどの大学のどの学部・学科も、入学時点では研究室や卒論内容なんかは全然決まっていなくて、必修の授業や自分の興味のある授業をどんどん受けて知識をゲットしていき、その中で興味のあることを見つけていきます。（入学時点で卒論ではこれをやりたい！と思っていることがあっても、わりと変わる人が多いみたいです（笑）。）
今は何が何だかよくわからないまま、将来の夢に関係あるかも？と糖やタンパク質のことを考えているのだと思いますが、きっと大学に入学して勉強しているうちに気になる分野が出てくると思います。
糖・タンパク質に固執しすぎて他の面白い分野を見落としてしまうのも勿体無いので、しばらくはもっと気軽に構えてみてはいかがでしょうか。
高校3年生ということですから、とりあえずは受験ですね……！

参考になるかはわかりませんが、お力になれていたら幸いです。
頑張ってください！