こんにちは。

3年生になってみてどうでしょうか？
さて，物理ですが，サイエンスの分野を学ぶものとして物理に興味が持てないのは致命的，というわけではないと思います。
だって，実際理系に進学している半分かそれくらいの学生は高校で物理をやっていないし，やっぱり大学でも苦労してますから。

それよりも致命的なのは，化学が嫌いとか，苦手であることです。ですので，というに応用分子専攻を目指している，ということで，まずは化学ありき，でいいと思ますよ。

でも，念のため，覚えておいてください。物理が全く必要でない，というわけではありません。もう質問にも書いてあるのでわかっていると思いますが，理系に限らず4年制大学に進学すれば一通り，数学も理科も（物理，化学，生物）を学びます。これは避けられないです。そして，それの基礎になるのが高校の学習内容であることは間違いないです。これを一応お頭に入れておいて，腰を据えて大学で勉強してもらえればいいと思いますよ。
ちなみに，私も物理は苦手でした。でも物理にもたくさんの分野があって，私の場合は力学は非常に苦手でしたが，波とか音の分野に入って，「あ，面白いな，これは」と思った記憶があります。

頑張ってくださいね～。