医学部はやっぱり医者の場ですからね～。みんな医師の資格を持って研究しているので，就職に関しては無関心なことが多いです。まわりが。でも，私の後輩で医学部に修士から入ってきて，ドクターをとった女性がいますが，彼女は研究所に就職できましたよ。
ですが，やはり新卒枠では難しかったので，修了後，研究室に研究員という形（無給）でのこって，なんとか就職活動して，就職にこぎつけた，という感じです。
つまりは，そうとう狭き門になってしまう，ということです。
その覚悟があって，医学系修士に行きたいというのであれば，極めて見てはどうでしょうか？
ただ，医学系に修士でとまるとなおさらきついので，ドクターまでを覚悟したほうがいいと思います。