どちらが良いのか，ということですが，それに関しては「あなたのよりやりたい方はどちらか？」ということに答えが尽きます。就職うんぬんよりも，「大学として，あなたがどちらを選択したいか」です。
院まで行くというはなしやお金の話は我々がどうこう言えることではなく，あなたが親御さんとしっかり話し合うべきことです。
やりたいことはどちらか，しっかり親にわかってもらって，そのうえで学費を出してほしいというように交渉すべきですね。
ちなみに，農学系から開発ですが，院に行かなくてもあなたの大学生活次第では就職できます。競争率もそれは高いですが，臨床検査の職に就くのもそうとう競争率は高いと思いますよ。就職に関しては同じようなものと考えていたほうがいいでしょう。ただ，臨床検査に関しては国家資格であるということ。農学では学士では資格とはみなされないので，自分の身分を農学でいうには博士号を取得するのがいいということ。
農学系でもどこでもそうですが，最近は院に進学する人がおおいので，もし進学するのであれば，修士という中途半端なところ（と考えられる）よりも，博士まで修了する覚悟でいたほうがいいかもしれません。
でも，博士になってもそれはそれで狭き門になります。

とにかく，今の段階であなたが決意すべきことは，大学で，どちらを学びたいか，です。