海外留学に限らず，就職活動を行う場所と所属大学が遠いと，やはり不利益はあります．

例えば，東京にいて東京の面接に出るためには1000円も交通費をかけずにすみますが，東京にいて九州の面接に出るためには1回で数万円の出費となってしまいます．
いわんや，海外からの渡航費をや．

私の友人の例ですが，日本の真ん中くらいにある地方国立大学の修士課程の学生が東京の企業への就職を希望すると，内定を得るまでに負担額が50万円を超えるくらいは普通とのことでした．

交通費をいくらかけても構わないというのでないかぎり，海外の大学院に進学するのであれば，まずはその国の現地採用で就職することが前提になります．