こんにちは。
まず、物理と化学が苦手である、ということを自分で今わかっていることは、それだけでも良かったことだと思います。

数学、化学、物理は、積み重ねの学問なので、一箇所わからないところが出来てしまうと、あとはずるずると、わからないまま引きずってしまいます。

もう一度、物理、化学の教科書の最初の方からじっくり学習するしかありません。
一時的に、進研ゼミなどの通信教育で、レベルの低い教材を勉強するのも手かも知れません。もし通信教育をやって見る場合は、バックナンバーもやらせてくれるか、出版社に問い合わせてみてください。
学習ペースがつかめるので、通信教育はお勧めです。
いきなり難しい教材を始めても、おそらくちんぷんかんぷんになってしまうと思います。

化学は、演習問題をひたすら繰り返して、問題と解答を覚えてしまう。
物理は、まずは、とにかく時間をかけてじっくり考える。
特に物理はコツがつかめれば、あとは早いです。
「なんでこんなことに悩んでいたんだろう？」という位びっくりします。

皇子さんは、進路のはなしを周囲の友人たちと、沢山話しているような環境の中にいるのではないでしょうか。とても理想的な環境にいると思います。
是非友達と助け合いながら、色々な困難を解決していってください。

就職の件ですが、会社の求人はおそらく学部指定をしていないと思います。
農学部、工学部のどちらでも良いと思います。

農学部、工学部で、迷う場合は、もし数学が苦手だったとしたら、農学部の方が良いかも知れません。ただし、選ぶ基準として、どちらの学部の学問が好きか、ということを検討してください。大学生活でつまらないと思うことをやっていても、やっぱりつまらないと思うのです。

まだ、あと１年あります。
理科は、結果が出るのが遅いので、やきもきするかもしれませんが、根性で乗り切ってください。
頑張ってください。