ちょうどよいイベントがまさに終わってしまったところなんですが、動画がアップされてるようなので是非みてみてください。

第3回宇宙（天文）を学べる大学合同進学説明会
http://tenkyo.net/shibu/kinki/20100612/

この説明会に参加されてる大学が日本で天文学を学べる主な大学と言えると思います。（参加されてない大学も一部あると思いますが）

「一番」の定義が難しいのですが（天文学の中にもいろいろな分野がありますので）
じっくり調べられるのがいいのではないでしょうか。

私のまわりの天文をやっている、あるいはやっていた人で多いのは（偶然かもしれませんが）東大、東工大、神戸大です。

天文学の分野はは一般（子供～大人まで）の人向けのイベントをいろいろやられてますのでそういうのにも行ってみておもしろそうな研究者や分野を探してみることをおすすめします！

手っ取り早く、天文学が盛んな大学を調べるには、ここを見てみてください。
http://www.asj.or.jp/nenkai/2010a/
一番最近の天文学会のプログラムです。
天文学会は、教授や助手、ポスドク、学生、さらに高校生も参加する、
日本で最大の天文研究者の集会です。
例えば超新星爆発をクリックしてください。
明らかに東京大学が一番多いですが、他にも色んな大学の人が講演しています。

ちなみに、意外と知られていないことですが、東京大学の天文分野の大学院受験は大学受験に比べるとかなり競争率は低いです。