文理選択の基準については、一概には言いきれないと思うので、ご質問の文面全般から感じた方向での回答をします。

中学までは得意だった数学が高校で出来ないと感じたということですが、例えば、①難しく考え過ぎている(苦手意識?)、②高校の理数系レベルが比較的高い環境で、自身の成績が相対的に劣勢になっている、③興味が持てない、など色々な要因があるかと思います。

文系も理系も同じくらい興味があるようでしたら、まずは数学に対する不得意の要因をもう少し掘り下げてみて、その対策がとってみてはいかがでしょうか。
そしてその対策が効果をあらわしそうであれば、その時点でもう一度、文理選択を天秤にかけてみてはいかがでしょうか。
ちなみに、文系科目が比較的得意(好き)なことは、文系理系いずれに進む場合にも、とても大切であり、かつ有利なことです。

話はそれましたが、理系で工学系に進むと、どうしても大学まで数学がついてきます。
基礎科目(一般教養)の際には、今後の専門課程で使う分野を中心に、数学の授業が残り、高校のさらに延長のようなかたちで授業やテストがあります。また、専門課程に入れば、それらの数学を(全部ではありませんが、選択した研究内容に応じて適宜)応用するようになります。

ただ、私も数学はさほど好きなほうではありませんでしたが、工学分野で使うようになってからは、今までただの知識と演習の繰り返しであった数学が、実態を伴ってみえてくるようになり、楽しくなったという経験があります。
長い目でみると、変化する面もあるので、高校の担当の先生に、得手不得手を伝えてみて、自身の現状把握をするのもよいかもしれません。

散逸的な文ですみませんが、ご参考まで。